sábado, 28 de maio de 2011

Terceiro fichamento

R. Bras. Zootec., v.36, suplemento especial, p.211-218, 2007


“Genética genômica e genômica quantitativa
são termos utilizados para representar o estudo de
processos genéticos controladores de caracteres
fenotípicos de herança complexa, a partir da
análise conjunta de informação relativa a
fenótipos, estruturas de parentesco, marcadores
moleculares e expressão gênica (Jansen & Nap,
2001; Darvasi, 2003; Pomp et al., 2004).”(p.211)
“O planejamento de estudos de genética
genômica envolve uma série de aspectos (...)
estudos de expressão gênica envolvem também a escolha cuidadosa
do(s) tecido(s) ou tipo(s) de célula(s), bem como
o(s) estágio(s) de desenvolvimento a serem
amostrados. Especificamente em relação aos
experimentos com microarrays, tem-se ainda que
decidir que tipo específico de tecnologia de
microarray mais se adequa aos objetivos
experimentais em questão, bem como quantas
lâminas são necessárias para que desejada
eficiência experimental seja alcançada.”(p.212)
“Fenotipagem seletiva
Até alguns anos atrás o custo de genotipagem
era um fator limitante em estudos de mapeamento.
Eram utilizadas então estratégias experimentais
tais como a genotipagem seletiva (Lebowitz et al.,
1987; Lander & Botstein, 1989; Darvasi & Soller,
1992; Allison et al., 1998). Em estudos de genética
genômica, entretanto, a fenotipagem é o fator
limitante dados os custos ainda bastante altos dos
experimentos com microarrays.”(p.213)
“Após a seleção dos indivíduos a serem utilizados
nos experimentos com microarrays, outro
importante passo no delineamento experimental
se faz necessário, especialmente se for utilizada a
tecnologia de hibridizações competitivas.”(p.214)
“A maioria da literatura existente na área
de delineamento de experimentos com
microarrays, entretanto, refere-se a situações nas
quais não existe um componente genético
definindo os diferentes grupos experimentais, de
maneira que os resultados não se aplicam diretamente
a um contexto de genética genômica.”(p.215)
“O procedimento proposto por Piepho (2005), no
entanto, aplica-se somente a situações com duas
linhagens recombinantes e o cruzamento F1, ou a
situações com um único gene candidato bialélico
(Rosa et al., 2006a). Uma metodologia mais geral
para o pareamento de amostras em experimentos com
microarrays em estudos de genética genômica
(incluindo também a otimização da marcação das
amostras em cada par) foi discutido por Bueno et
al. (2006).”(p.215)

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